Đế chế Inca bị chinh phục bởi người Tây Ban Nha, dẫn đầu bởi Francisco Pizarro và các anh em của ông, từ năm 1532 đến 1572. Mặc dù người Inca kháng cự, họ đã bị suy yếu bởi bệnh đậu mùa và nội chiến, điều này đã giúp người Tây Ban Nha đánh bại họ và sau đó phá hủy phần lớn văn hóa của họ.
Nguyên nhân lớn nhất dẫn đến thất bại của người Inca là bệnh tật. Từ 60 đến 94 phần trăm dân số Inca đã bị tiêu diệt bởi bệnh đậu mùa trước khi người Tây Ban Nha đến đầu tiên. Điều này khiến đế chế suy yếu. Ngoài ra, một cuộc nội chiến đẫm máu giữa Atahualpa và Huáscar, con trai của người cai trị người Inca đã qua đời là Huayna Capac, đã chia rẽ người Incans và cho phép người Tây Ban Nha khai thác những rạn nứt xã hội đã hình thành, hỗ trợ cho cuộc chinh phục cuối cùng của họ.