Thân rễ là một thân ngang của thực vật hình thành rễ và chồi mới. Nhiều loài thực vật xâm lấn tạo thành thân rễ nên rất khó diệt trừ. Khi bị cắt khỏi cây mẹ, thân rễ hình thành một cây mới, không giống như nhiều rễ bị chết.
Nhiều loại thực vật, bao gồm hoa loa kèn, cỏ càng cua, cây diên vĩ và gừng nhân giống bằng thân rễ. Thân rễ của cây gừng là phần rễ nấu ăn được dùng làm gia vị. Một số mô của thân rễ tích trữ tinh bột, như trong trường hợp của cây dong riềng thật. Trong các loài dương xỉ và hoa súng, thân rễ là thân duy nhất mà thực vật hình thành.
Những người làm vườn thường sử dụng thân rễ được gọi là gốc ghép trong việc nhân giống cây trồng, chẳng hạn như măng tây, lily of the Valley và cannas cũng như một số loài lan, thông qua sinh sản sinh dưỡng. Nhân giống từ thân rễ là một hình thức sinh sản vô tính, với cây thu được giống về mặt di truyền với cây bố mẹ. Vì các cây giống hệt nhau về mặt di truyền nên chúng tạo ra hoa có màu sắc giống nhau mà không có sự biến đổi.
Các cây khác hình thành thân ngầm để nhân giống cây mà không hình thành thân rễ. Củ, thân, dây và củ đều là thân ngầm, nhưng mỗi loại khác với thân rễ. Khoai tây trắng là loại củ, và trong khi chúng hình thành thân mới từ mắt, chúng không tạo ra chồi giống như ở thân rễ.