Hầu hết các thân nấm đều có thể ăn được. Ngoại lệ duy nhất là phần thân của nấm đông cô vì nó rất dai và khó nhai ngay cả khi đã nấu chín.
Nhiều người sử dụng nấm trong súp, trong món salad, trên bánh pizza và trong các món ăn khác. Khi sử dụng nấm, lau sạch bụi bẩn bên ngoài và nấm đã sẵn sàng. Nấm có thể dùng nguyên con hoặc thái hạt lựu. Khi sử dụng thân cây, tốt nhất nên cắt phần đầu ở phía dưới vì phần đó có xu hướng trở nên xốp và cứng.
Khi chế biến nấm, đặc biệt là những loại nấm lớn như nấm portabellas, nhiều người chọn cách cắt bỏ cuống trước khi nấu. Điều này rất dễ thực hiện - bật cuống ra khỏi nắp và nấm đã sẵn sàng để nấu. Đối với nấm đông cô, vì phần thân không ăn được nên cần phải cắt bỏ. Để thực hiện việc này, hãy kẹp chặt phần thân cây ở nơi nó gặp nắp, sau đó kéo nó ra, để càng nhiều nắp càng tốt. Mặc dù phần thân của nấm sò có thể ăn được nhưng nhiều người vẫn thích cắt bỏ chúng để dành làm kho hoặc vứt đi. Chỉ cần cắt xung quanh thân cây và mũ sẽ rơi ra.
