Sự thụ phấn khác nhau giữa thực vật hạt kín và thực vật hạt trần ở chỗ hầu hết thực vật hạt kín lôi kéo động vật mang phấn hoa của chúng từ cây này sang cây khác, trong khi hầu hết cây hạt trần dựa vào gió để mang phấn hoa của chúng đến các cây khác. Có nhiều gió- Tuy nhiên, thực vật hạt kín thụ phấn và một số rất ít thực vật hạt trần thụ phấn. Các phương pháp mà cây hạt kín sử dụng có xu hướng hiệu quả hơn trong việc lây lan nhanh chóng, nhưng cây hạt trần, đặc biệt là cây lá kim, thường thích nghi tốt hơn với môi trường lạnh hoặc khô.
Theo Đại học Tulane, thực vật hạt trần là nhóm thực vật chính đầu tiên xuất hiện sau dương xỉ và các đồng minh của chúng, thay thế nhóm trước đó thành thực vật thống trị trên cạn. Tuy nhiên, thực vật hạt kín xuất hiện tương đối sớm sau đó và nhanh chóng thay thế các thực vật hạt trần lần lượt. Tuy nhiên, sự thống trị của chúng không hoàn toàn vì một nhóm cây hạt trần, cây lá kim, vẫn chiếm ưu thế ở những vùng lạnh hơn và ở độ cao cao hơn.
Thực vật hạt kín có nhiều mô tiên tiến hơn và đa dạng hơn nhiều so với thực vật hạt trần hiện đại, một phần lớn là do phương pháp thụ phấn hiệu quả hơn của chúng. Điều này đặc biệt đúng ở những nơi có nhiều côn trùng thụ phấn. Tuy nhiên, ngay cả với các loài thụ phấn nhờ gió, chẳng hạn như cỏ, khả năng phát triển nhanh chóng của chúng cho phép chúng trở thành hệ thực vật tiên phong trong nhiều môi trường, bắt đầu kế thừa môi trường ngay cả khi các giai đoạn sau bị cây hạt trần thống trị.