Thụ phấn là quá trình mà hạt phấn di chuyển từ bao phấn đến vòi nhụy theo kiểu hoa, trong khi thụ tinh là sự hợp nhất của giao tử đực và tế bào trứng cái để tạo thành hạt cây mới. Sự thụ phấn có trước sự thụ tinh và phụ thuộc vào các phương tiện truyền thông như gió, nước và côn trùng. Sự thụ phấn diễn ra bên ngoài, trong khi sự thụ tinh xảy ra ở bên trong hoa và không phụ thuộc vào các vật trung gian bên ngoài.
Nếu không có tác nhân thụ phấn thích hợp để mang phấn từ cây này sang cây khác, thì cây có thể tự thụ phấn trong một quá trình gọi là tự thụ phấn. Trong trường hợp này, giao tử đực được chuyển từ bao phấn đến vòi nhụy của cùng một hoa hoặc đến vòi nhụy của hoa khác của cùng một cây. Tuy nhiên, một số cây có cơ chế chiến lược để ngăn cản quá trình tự thụ phấn. Kiểu hình bắt đầu cao hơn bao phấn, khiến cho quá trình tự thụ phấn không thể thực hiện được. Nếu không có tác nhân thụ phấn nào xuất hiện thì bao phấn mọc cao hơn kiểu dáng và thụ phấn cho nó. Hạt thụ tinh phát sinh từ quá trình tự thụ phấn không tốt bằng hạt thụ phấn. Chúng thường giống hệt nhau về mặt di truyền với cây mẹ. Nếu cây bố mẹ bị dị tật thì cây con cũng vậy. Thụ phấn chéo vẫn là một cách tuyệt vời để thụ tinh hạt lai, đôi khi trong điều kiện phòng thí nghiệm được kiểm soát.
