Những bất lợi chính của việc mua hàng tại địa phương bao gồm khả năng tiếp cận với nhiều loại sản phẩm hạn chế, giá cao hơn và mua sắm ở nhiều địa điểm. Một bất lợi khác là thiếu quy định áp dụng cho nông dân địa phương và quy mô nhỏ.
Mặc dù mua địa phương tại chợ nông sản có lợi thế, nhưng một nhược điểm chính là thiếu chủng loại. Một hộ nông dân nhỏ chỉ trồng nhiều loại rau quả nên cần phải di chuyển đến các địa điểm khác để có nhiều sản phẩm.
Nông dân địa phương quy mô nhỏ không được tiếp cận với các nguồn tài nguyên mà các trang trại lớn hơn sử dụng để hiệu quả hơn và thân thiện với môi trường. Các hộ nông dân nhỏ thường không đủ khả năng đầu tư vào các nguồn năng lượng thay thế như gió hoặc năng lượng mặt trời. Thường nằm trong các cộng đồng nông thôn bị cô lập, các hộ nông dân nhỏ phải mang theo thiết bị và vật tư bằng xe tải hoặc đường sắt. Việc vận chuyển sẽ phủ nhận bất kỳ tác động tích cực nào của người trồng địa phương đối với môi trường. Chi phí vận chuyển cũng yêu cầu các hộ nông dân nhỏ phải tính thêm tiền cho sản phẩm của họ.
Các cơ quan chính phủ không quản lý hoặc kiểm tra các trang trại nhỏ. Điều này có nghĩa là rất khó để biết trang trại hoạt động như thế nào và liệu các mặt hàng được dán nhãn là hữu cơ có đủ tiêu chuẩn cho sự khác biệt đó hay không ..
Mua tại địa phương có thể có ảnh hưởng tích cực đến nền kinh tế địa phương, nhưng nhiều loại sản phẩm được trồng ở các nước nghèo. Các quốc gia này thường dựa vào hàng hóa xuất khẩu để đảm bảo tài chính của họ. Không mua hàng hóa nhập khẩu có tác động tiêu cực đến nền kinh tế toàn cầu.