Chức năng của RNA polymerase II là tổng hợp mRNA bằng cách sử dụng sợi DNA làm khuôn mẫu, UC Davis BioWiki giải thích. Quá trình mà một sợi mRNA được tạo ra từ một sợi DNA, được gọi là phiên âm và sản phẩm được gọi là bản ghi chính, Đại học Bang North Dakota lưu ý.
Để bắt đầu phiên mã, RNA polymerase II liên kết với một đoạn trên gen được gọi là promoter, Đại học North Dakota State giải thích. Promoter bao gồm các trình tự nucleotide, là TATAAT và TTGACA ở sinh vật nhân thực và TATA và CAAT ở sinh vật nhân sơ. T là viết tắt của nucleotide thymine, A là adenine, G là guanine và C là cytosine, Pearson Prentice Hall lưu ý. Trong tế bào vi khuẩn, một phân tử được gọi là yếu tố sigma phải có mặt để RNA polymerase II có thể xác định được promoter. Trong các tế bào nhân thực, các yếu tố phiên mã giúp RNA polymerase II xác định vị trí của promoter, Đại học North Dakota State giải thích.
Mặc dù dạng RNA polymerase được tham chiếu phổ biến nhất là RNA polymerase II, cũng có hai dạng ít được biết đến hơn, UC Davis BioWiki lưu ý. Đầu tiên là RNA polymerase I, nằm trong nucleolus của tế bào và tham gia vào quá trình tổng hợp rRNA. Loại thứ hai là RNA polymerase III, được tìm thấy trong nucleoplasm và liên quan đến việc tổng hợp tRNA và một số snRNA nhất định.