Apoenzyme là các protein hình thành hệ thống enzyme hoạt động bằng cách kết hợp với coenzyme và thiết lập tính đặc hiệu của hệ thống cho một cơ chất. Trước khi bước vào quá trình tổng hợp này, nó thường không hoạt động; trước khi tham gia với coenzyme hoặc cofactor, nó còn được gọi là zymogen hoặc proenzyme. Trong một số trường hợp, trạng thái ban đầu chứa một số axit amin bổ sung trước khi nó có cấu trúc cuối cùng như một apoenzyme.
Một apoenzyme chỉ là một phần trong cấu trúc của một loại enzyme lớn hơn. Hoạt động của enzyme phụ thuộc vào một chuỗi protein cụ thể. Các đồng yếu tố, hoặc coenzyme, không phải lúc nào cũng là chất hữu cơ, nhưng chúng thường đến từ một loại vitamin. Tuy nhiên, một loại đồng yếu tố khác là chất hoạt hóa ion kim loại. Vô cơ, các ion kim loại thường tham gia bằng liên kết cộng hóa trị tọa độ. Mục đích đằng sau dinh dưỡng cần thiết cho khoáng chất là cung cấp cho cơ thể các ion tạo ra các enzym khi kết hợp với các nguyên tử phân cực khác.
Apoenzyme hình thành các kiểu liên kết khác nhau với các đồng yếu tố. Nhiều trường hợp có liên kết lỏng lẻo và cả hai chỉ kết hợp với nhau khi phản ứng xảy ra. Trong các trường hợp khác, liên kết cộng hóa trị giữ chúng cố định với nhau. Mục đích của cofactor là thay đổi protein sang trạng thái hoạt động bằng cách thay đổi cấu trúc của nó hoặc bằng cách tự diễn ra phản ứng. Phân tử mà enzym hoạt động là cơ chất.