Bánh bí đỏ có thể đông lại nhưng có thể có kết cấu hơi khác sau khi rã đông. Hương vị phải giống như bánh bí ngô tươi.
Trước khi làm đông bánh bí ngô, hãy đảm bảo rằng bánh đã được làm lạnh kỹ. Sau đó, dùng màng bọc thực phẩm bọc toàn bộ chiếc bánh lại, đảm bảo bọc kín từng miếng bánh. Tiếp theo, bọc nó trong một lớp giấy nhôm để ngăn bánh bị bốc mùi từ ngăn đá. Đặt nó vào tủ đông, nơi nó có thể nằm phẳng. Bánh bí ngô có thể được bảo quản trong tủ đông đến hai tháng. Không làm đông lạnh bánh bí ngô đã được làm đông lạnh trước đó.