Trình tự Shine-Dalgarno là một sự sắp xếp cụ thể, giàu purin của các nucleotide trong mRNA nhân sơ nhằm mục tiêu RNA tới một tiểu đơn vị nhỏ của ribosome để dịch mã. Trình tự này cần thiết để liên kết ribosome và tổng hợp protein xảy ra trong tế bào nhân sơ. Nó còn được gọi là vị trí liên kết ribosome.
Trình tự Shine-Dalgarno nằm ngược dòng từ nơi diễn ra quá trình dịch mRNA thành protein, trong vùng 5 'chưa được dịch mã, hoặc 5' UTR. Có nhiều cách sắp xếp các nucleotide có thể nhắm mục tiêu mRNA của tế bào nhân sơ đến ribosome để quá trình dịch mã xảy ra, và nhiều trình tự Shine-Dalgarno đã được các nhà khoa học mô tả. Thông thường, trình tự được nhìn thấy khoảng 8 đến 10 codon ngược dòng mã khởi đầu AUG báo hiệu sự bắt đầu của quá trình dịch mã mRNA của tế bào nhân sơ. Mặc dù có nhiều trình tự Shine-Dalgarno, tất cả chúng đều chia sẻ trình tự đồng thuận gồm sáu nucleotide theo một thứ tự cụ thể: AGGAGG.
Việc đưa các đột biến vào trình tự Shine-Dalgarno có thể có những tác động khác nhau tùy thuộc vào loại đột biến và vị trí của nó. Một đột biến đối với trình tự có thể làm tăng tốc độ dịch mã, giảm tốc độ hoặc không có tác động.
Trình tự Shine-Dalgarno lần đầu tiên được mô tả bởi các nhà khoa học Úc John Shine và Lynn Dalgarno. Trình tự cũng đã được nhìn thấy trong archaea.
