Marquette nổi tiếng với việc khám phá Sông Mississippi, bao phủ khoảng 1.700 dặm từ ngã ba của Sông Wisconsin với Mississippi đến Sông Arkansas. Marquette đã đi du lịch cùng Louis Jolliet và cùng nhau, họ không chỉ tìm thấy dòng sông mà còn đi qua nơi một ngày nào đó sẽ trở thành Chicago.
Marquette đã dành phần lớn thời gian du lịch của mình để ghi lại những điều mà các du khách đã thấy. Ông là một trong những người châu Âu đầu tiên nhìn thấy và mô tả phần lớn các loài động vật hoang dã trong khu vực. Họ đã tìm thấy nhiều ngôi làng của người Mỹ bản địa dọc theo hoặc gần sông và học hỏi được nhiều điều từ họ, giống như thực tế là sông tiếp tục chảy xuống vực.
