Tính năng lấy dấu vân tay DNA cung cấp thông tin có thể xác định thời điểm một sinh vật tách khỏi loài tổ tiên của nó, cho phép phân loại theo lớp. Sự khác biệt có thể định lượng trong DNA giữa hai loài xác định khoảng cách tiến hóa của chúng.
Cladistics xếp các sinh vật vào các cụm - cây họ gồm các loài phù hợp với tổ tiên và con cháu của nó. Các nhánh ngoài đường thẳng trở thành nhánh mới. Một bản đồ ghi lại thông tin này dưới dạng đồ họa của dòng họ và phân nhánh.
Tốc độ xác định trình tự DNA của các sinh vật đang áp đảo các phương pháp phân loại dựa trên loài truyền thống. Cladistics định vị các sinh vật trên bản đồ hệ gen nhưng không tính đến bằng chứng về các loài sinh vật mới cũng như việc ghi lại hồ sơ bộ gen của chúng. Mã hóa di truyền cung cấp một phương pháp để nắm bắt thông tin di truyền trước khi có bằng chứng xác định loài. Dữ liệu này hoạt động như một mã vạch sinh học, xác định sinh vật về mặt di truyền bất kể những thay đổi đối với hệ thống phân loại.
Nhiều nguồn thông tin hiện có và khả năng xuất hiện các loại thông tin mới trong tương lai đòi hỏi một hệ thống có khả năng thích ứng với các điều kiện thay đổi. Các lĩnh vực mới của phân loại học và tin học đa dạng sinh học đang giải quyết những mối quan tâm đó bằng cách xây dựng một lược đồ phân loại học và các nguồn tài nguyên khác cho các định nghĩa loài trực tuyến. Duy trì quyền truy cập vào các tài nguyên trực tuyến theo thời gian là một vấn đề quan trọng.
