Sự khác biệt cơ bản giữa lông mao và lông roi là cách chúng được tổ chức. Lông mao và lông roi đều là những phần mở rộng linh hoạt giúp tế bào di chuyển.
Lông mao và lông roi là những bào quan hoặc phần mở rộng của tế bào có cấu trúc tương tự nhau, hỗ trợ sự di chuyển của tế bào. Tế bào thường có một hoặc hai roi dài hơn và nhiều lông mao ngắn hơn. Chuyển động đập của lông mao khác với lông roi, ở lông roi đó chuyển động giống như sóng và lông mao di chuyển theo cách phức tạp hơn.
Một trùng roi có thể di chuyển một tế bào theo cách giống như roi hoặc hai trùng roi có thể di chuyển song song. Tuy nhiên, lông mao bao phủ hầu hết cơ thể của tế bào và đập theo cách phối hợp.