Động vật nguyên sinh di chuyển bằng cách sử dụng lông mao, lông roi và lông giả. Phương thức di chuyển khác nhau tùy thuộc vào loại động vật nguyên sinh và nơi chúng sống.
Chuyển động của một số sinh vật nguyên sinh được kích hoạt bởi các lông mao, là những hình chiếu nhỏ giống như sợi tóc kéo dài từ bề mặt của chúng hoặc từ bên trong tế bào. Lông mao cho phép sinh vật nguyên sinh di chuyển theo nhịp điệu khi chúng bơi trong nước. Các sinh vật nguyên sinh khác di chuyển bằng cách sử dụng roi, là những phần phụ dài và có sợi giống như những chiếc roi dài và giúp các sinh vật di chuyển ổn định qua các dòng chảy và sóng. Pseudopodia là loại vận động protist thứ ba. Sự di chuyển này liên quan đến sự chiếu tạm thời của tế bào chất qua các tế bào nhất định, chẳng hạn như tế bào thực bào.
