Độ pH trong ruột non tăng từ pH 6 trong tá tràng đến pH 7,4 ở đầu xa của ruột non trong hồi tràng cuối. Độ pH giảm đến pH 5,7 trong manh tràng nhưng tăng đến pH 6,7 trong trực tràng.
Phần có tính axit cao nhất trong đường tiêu hóa của con người là dạ dày, thường nằm trong khoảng pH từ 1 đến pH 3. Độ axit cao trong dạ dày chống lại vi khuẩn ăn vào cùng với thức ăn. Khi khoảng cách từ dạ dày tăng lên, nồng độ pH tăng dần. Ruột già có độ pH từ 5,5 đến pH 7.