Thời hạn sử dụng của nước ép cà chua trong tủ lạnh khi đã mở nắp là từ 5 đến 7 ngày. Không nên để loại nước ép này ở nhiệt độ phòng quá 2 giờ.
Nước ép cà chua có thể để được đến một năm trong tủ đông khi được bảo quản trong hộp kín. Khi đông lạnh loại nước trái cây này, điều quan trọng là phải để ít nhất nửa inch trong hộp để có thể giãn nở khi đông lạnh.
Nước ép cà chua chưa mở nắp có thời hạn sử dụng từ 2 đến 3 tháng nếu được bảo quản đúng cách. Nếu nước trái cây có mùi nặng và hôi hoặc đã thay đổi màu sắc thì nên bỏ đi.