Mùi chua, sự đổi màu và sự phát triển của nấm mốc đều là những dấu hiệu cho thấy nước cam đã bị hỏng và nên bỏ đi. Mùi chua thường là dấu hiệu dễ nhận thấy đầu tiên của sự hư hỏng, trong khi sự phát triển của nấm mốc là dấu hiệu cuối cùng.
Khi có bất kỳ mùi bất thường hoặc nấm mốc nào xuất hiện trong nước cam, bạn nên vứt nước cam đi mà không cần nếm thử. Mùi chua xuất hiện trong nước cam là do các vi sinh vật xâm nhập vào nước trái cây và bắt đầu lên men. Trong một số trường hợp, mùi này có thể có mùi tương tự như rượu, bia, giấm hoặc các loại rượu khác. Khi có vi sinh vật, thùng chứa nước trái cây cũng có thể bị phồng lên hoặc thậm chí vỡ nếu quá trình lên men được phép tiếp tục mà không được kiểm soát.
Một hộp nước cam chưa mở sẽ để được từ một đến hai tuần trong tủ lạnh, trong khi một hộp nước cam đã mở nắp có thể để được từ năm đến bảy ngày. Sau khi mở nắp, nên bảo quản nước trái cây trong hộp có nắp đậy kín để tránh chất bẩn và hơi ẩm xâm nhập, có thể rút ngắn thời hạn sử dụng hơn nữa. Nước cam sau khi mở nắp cần được bảo quản kịp thời trong tủ lạnh để ngăn chặn sự phát triển của vi khuẩn. Nước cam cũng có thể được đông lạnh để kéo dài thời hạn sử dụng hơn nữa.