Ghép cặp bazơ là liên kết cụ thể của các bazơ nucleotit bổ sung với nhau trong axit nucleic. Trong kết đôi bazơ, một liên kết purin với một pyrimidin; cụ thể, guanin tạo liên kết với cytosine và liên kết adenin với thymine hoặc uracil, tùy thuộc vào loại axit nucleic có liên quan.
Sự kết cặp cơ sở đặc biệt đến mức nếu biết một sợi DNA, thì sợi kia có thể được tái tạo lại. Quá trình này tạo cơ sở cho quá trình sao chép DNA và phiên mã RNA thông tin.
Độ chính xác của việc ghép nối cơ sở đến từ kích thước của các cơ sở. Hai nhân purin không thể nằm trên một nấc, và hai pyrimidin không đủ dài để kéo dài một nấc của phân tử axit nucleic. Khái niệm này được gọi là quy luật Chargaff về sự bắt cặp cơ sở DNA. Quy tắc này cũng giải thích tại sao lượng adenine và thymine tương đương nhau và lượng cytosine và guanine bằng nhau trong một phân tử DNA.
