Một cấu trúc bao gồm hai hoặc nhiều mô hoạt động cùng nhau để thực hiện một chức năng cụ thể được gọi là cơ quan. Gan là cơ quan lớn nhất cũng như nặng nhất trong cơ thể con người. Các cơ quan chính khác bao gồm tim, não, phổi, thận và dạ dày.
Một hệ thống cơ quan được hình thành khi một nhóm các cơ quan làm việc cùng nhau để thực hiện một quá trình cụ thể. Ví dụ, hệ tiêu hóa được tạo thành từ dạ dày, ruột non và ruột già. Hệ thống nội tiết bao gồm tuyến giáp, tuyến yên và tuyến ức. Một số hệ thống cơ quan tồn tại trong cơ thể con người.