Phô mai mozzarella đã qua chế biến có thể đông lạnh và giữ được tối đa sáu tháng trong tủ đông. Phô mai mozzarella mất độ ẩm khi đông lạnh và có kết cấu vụn. Do kết cấu này, phô mai mozzarella đã rã đông chỉ thích hợp cho các mục đích sử dụng trong đó nó được nấu chảy.
Phô mai mozzarella tươi không đông lạnh như các loại đã chế biến và không thích hợp để đông lạnh. Không thể thay thế phô mai mozzarella đã rã đông trong các công thức nấu ăn yêu cầu phô mai tươi. Điều này là do sự khác biệt về hương vị và kết cấu. Phô mai mozzarella ít béo có nhiều nước hơn so với các loại phô mai nguyên chất, điều này ảnh hưởng đến lượng ẩm bị mất đi trong quá trình đông lạnh và độ tan chảy của nó khi rã đông.
