Ô nhiễm nguồn phi điểm bao gồm hóa chất nông nghiệp, chất thải động vật và dòng chảy đô thị. Không giống như ô nhiễm theo vết từ một nguồn duy nhất như nhà máy, ô nhiễm nguồn phi điểm đến từ nhiều địa điểm khác nhau. Nước chảy ra từ các cơn bão mang theo các chất ô nhiễm đến các suối, hồ và sông.
Theo EPA, ô nhiễm nguồn phi điểm là nguyên nhân hàng đầu gây ra các vấn đề về chất lượng nước vào năm 2010. Mỗi cá nhân đều đóng một vai trò trong ô nhiễm nguồn phi điểm mà thường không nhận ra. Những người nông dân bón quá nhiều phân bón, quá nhiều thuốc diệt cỏ hoặc quá nhiều hóa chất khác cho cây trồng của họ làm tăng ô nhiễm ở các dòng suối gần đó. Chất thải chăn nuôi làm tăng ô nhiễm hóa chất và vi khuẩn.
Tại các khu vực đô thị, nhiều loại ô nhiễm nguồn không điểm ảnh hưởng đến nước mặt. Việc sử dụng hóa chất làm cỏ không đúng cách cũng đóng một vai trò trong vấn đề này. Dầu hoặc nhiên liệu rò rỉ từ các phương tiện giao thông chảy thành dòng. Việc xây dựng mới làm tăng đất và trầm tích trong các dòng suối. Chủ sở hữu vật nuôi không dọn sạch chất thải vật nuôi sẽ khiến chất lượng nước giảm sút.
Ô nhiễm nguồn không điểm thêm trầm tích, chất dinh dưỡng, chất độc, hóa chất và mầm bệnh vào nước mà nó gây ô nhiễm. Nó có thể biến dòng sống thành dòng không còn khả năng hỗ trợ cuộc sống. Kiểm soát ô nhiễm nguồn phi điểm cần nỗ lực thống nhất của tất cả những người đóng góp vào việc đó.