Tài nguyên thiên nhiên của Nhật Bản bao gồm cá, nông nghiệp và một lượng nhỏ kim loại và khoáng sản. Nhật Bản nổi tiếng với sản lượng công nghiệp mạnh và mức sống cao mặc dù có rất ít tài nguyên thiên nhiên, đặc biệt là trong khu vực năng lượng tự nhiên.
Nhật Bản có các vùng nước ven biển quan trọng, cung cấp cá và các loại hải sản khác cho đất nước. Tuy nhiên, nhu cầu cá tăng cao nên phải nhập khẩu từ nước ngoài. Mặc dù Nhật Bản có ít đất canh tác, nhưng nước này lại có một số năng suất cây trồng cao nhất trên thế giới, sản xuất hơn 60% lương thực mỗi năm. Quốc gia này có đủ nguồn cung cấp vàng, bạc và magiê, nhưng nước này phải nhập khẩu nhiều khoáng sản cần thiết cho ngành công nghiệp điện tử đang bùng nổ của mình, chẳng hạn như quặng sắt và đồng.
Điều đáng chú ý là thiếu các nguồn tài nguyên thiên nhiên của đất nước là bất kỳ nguồn năng lượng tự nhiên nào. Nhật Bản hầu như không có tài nguyên nhiên liệu hóa thạch, với các mỏ dầu nhỏ ở khu vực phía bắc Honshu và Hokkaido cung cấp ít hơn 1% lượng dầu của cả nước. Nhật Bản là nhà nhập khẩu than đá và khí đốt tự nhiên hóa lỏng lớn nhất thế giới, đồng thời là nhà nhập khẩu dầu mỏ lớn thứ hai. Do sự khan hiếm này, Nhật Bản đã khai thác nguồn cung cấp nước dồi dào làm nguồn năng lượng, tự hào là một trong những ngành công nghiệp thủy điện lớn nhất thế giới.
