Một nguyên nhân phổ biến khiến cà chua bị thối rữa trước khi chín là thối đầu hoa. Nguyên nhân là do cây thiếu canxi, nhưng việc tưới nước, từ tự nhiên hoặc từ người làm vườn, thường là nguyên nhân nhất chứ không phải do đất thiếu canxi.
Trong hầu hết các trường hợp hoa bị thối, thiếu nước hoặc không có mưa sẽ làm cho đất xung quanh cây bị khô. Khi cây héo, người làm vườn tưới nước cho cây. Cây cà chua có khả năng phục hồi và thường bật lại trong tình huống này. Tuy nhiên, thiệt hại đã được thực hiện đối với nhà máy. Rễ không thể hấp thụ canxi từ đất khô và thối rữa xuất hiện khi quả hình thành.
Quá nhiều nước cũng có thể làm loãng canxi trong đất, dẫn đến thối đầu hoa. Trong trường hợp này, bón lót cho cây bằng bột xương có thể giúp tăng lượng canxi trong đất. Thuốc xịt trị thối đầu hoa, có thể dùng trực tiếp trên tán lá, cũng có thể hữu ích.
Điều quan trọng là phải loại bỏ bất kỳ trái nào bị thối đầu hoa. Quả này sẽ tiếp tục phát triển và sử dụng năng lượng của cây. Việc cắt bỏ quả cho phép cây sử dụng năng lượng để tạo ra quả mới hy vọng không bị thối.
