Xanh metylen được sử dụng để nhuộm tế bào động vật để làm cho hạt nhân nhìn thấy rõ hơn dưới kính hiển vi. Xanh metylen thường được sử dụng khi nhuộm tế bào má của con người, giải thích trên trang web của Đại học Carlton.
Nhuộm tế bào rất hữu ích vì nó giúp tăng cường hình dung các thành phần cụ thể trong tế bào. Nhuộm tế bào cũng có thể được sử dụng để làm nổi bật các quá trình, chẳng hạn như các giai đoạn trong quá trình phân chia tế bào. Xanh methylen đặc biệt được sử dụng để nhuộm tế bào động vật và màng máu. Phương tiện nhuộm này hoạt động bằng cách nhuộm nhân tế bào và làm cho cấu trúc cụ thể có thể nhìn thấy rõ hơn dưới kính hiển vi ánh sáng. Bất kỳ loại mô nào có thể hấp thụ các vết bẩn và thuốc nhuộm được gọi là chromatic. Không có vết bẩn, chẳng hạn như xanh methylen, các tế bào gần như trong suốt dưới kính hiển vi. Loại vết được sử dụng xác định các kỹ thuật và chế phẩm trượt phải được thực hiện; các ví dụ bao gồm cố định nhiệt, thêm chất cố định hóa học, xử lý bằng chất hoạt động bề mặt nhẹ, gắn và ngâm vào dung dịch thuốc nhuộm. Màu xanh lá cây Malachite, được sử dụng để nhuộm bào tử, và iốt, một chất chỉ thị tinh bột, là những loại thuốc nhuộm phổ biến khác được sử dụng để nhuộm tế bào. Các slide đã nhuộm màu có thể được bảo quản bằng cách bảo quản slide trong tủ lạnh hoặc trong môi trường tối để sau này quan sát dưới kính hiển vi ánh sáng. Các vết bẩn cũng có thể được sử dụng trong kính hiển vi điện tử truyền qua.
