Một trong những điểm khác biệt chính giữa nghêu và hàu là nghêu luôn di chuyển trong suốt cuộc đời của chúng, tự kéo mình qua cát bằng một bàn chân vươn ra bên ngoài vỏ của chúng. Sau giai đoạn ấu trùng ngắn khi bắt đầu sống, hàu bám vào các hàu hoặc đá khác và sống cả đời ở một nơi.
Sự khác biệt khác giữa trai và hàu là những biến thể tinh tế ở các loài hai mảnh vỏ có liên quan. Cả trai và sò đều được xếp vào nhóm động vật thân mềm nên chúng có cấu tạo giải phẫu tương tự nhau. Trong khi trai và hàu có hai lớp vỏ, thì cả hai lớp vỏ của một con ngao đều giống nhau. Một trong những vỏ hàu có hình khum trong khi vỏ còn lại thì phẳng. Kết cấu mịn hơn của vỏ ngao giúp chúng đào bới cát. Trong khi hàu có mang, hầu hết các loài trai đều lọc dinh dưỡng và nước qua một ống xi phông kéo dài qua cát. Mặc dù cả hai đều có thể sống ở nước lợ và nước mặn, nhưng nhiều loài ngao lại sống ở nước ngọt. Vì nghêu thường sống vùi trong cát và trầm tích còn hàu sống ở vùng nước lộ thiên nên chế độ ăn của chúng hơi khác một chút. Sự khác biệt trong chế độ ăn uống dẫn đến sự khác biệt về hương vị khi tiêu thụ động vật có vỏ. Ngoài ra, thịt của chúng có màu sắc và kết cấu khác nhau. Hầu hết nghêu có màu hơi hồng và dai, trong khi hàu có màu xám đen và mềm.
