Nếu không được đóng gói và được bảo quản trong hộp đậy kín, bánh pho mát có thể giữ trong tủ lạnh đến một tuần. Để giữ được hương vị và kết cấu tối ưu, bánh phô mai nên được bảo quản trong tủ lạnh không quá hai ngày trước khi phục vụ.
Cheesecake có thể bảo quản trong ngăn đá từ một tháng trở lên. Tốt nhất là lấy đồ trang trí ra và bọc nó trong một lớp màng bọc thực phẩm, sau đó là một lớp giấy bạc trước khi cho vào ngăn đá. Tối hôm trước, lấy bánh pho mát ra khỏi ngăn đá, gói lại và để tủ lạnh qua đêm để rã đông trước khi dùng sẽ mang lại kết quả tốt nhất.
