Protein đóng góp vào tất cả các chức năng sinh lý của cơ thể sống, ghi chú Hyperphysics. Chúng bao gồm vận chuyển các chất xung quanh cơ thể và qua màng tế bào, xúc tác các phản ứng hóa học và cung cấp tính toàn vẹn về cấu trúc cho các cơ quan và mô.
Protein là các đại phân tử sinh học chiếm khoảng 75% trọng lượng khô của cơ thể con người. Viện Y tế Quốc gia ghi nhận bộ gen của con người có từ 20.000 đến 25.000 protein. Một số gen có thể mã hóa nhiều protein và protein có thể được biến đổi về mặt hóa học, chẳng hạn như thông qua quá trình phosphoryl hóa, để thay đổi chức năng của chúng theo tự nhiên, vì vậy số lượng phân tử protein độc nhất của con người có thể lớn hơn nhiều.
Các chức năng của protein trong cơ thể con người vô cùng đa dạng. Hemoglobin, nằm trong các tế bào hồng cầu, mang oxy đi khắp cơ thể. Các kênh kali, có trong màng tế bào, cho phép các ion kali đi vào và ra khỏi tế bào, điều này rất quan trọng cho sự giao tiếp giữa các tế bào trong hệ thần kinh trung ương. Keratin là một protein cấu trúc cung cấp độ chắc khỏe cho tóc, móng tay và lớp ngoài của da. Myosin là một protein trong tế bào cơ bò dọc theo các sợi của protein cấu trúc, actin, để gây co cơ. Cuối cùng là hexokinase, chất xúc tác bước đầu tiên của quá trình phân hủy glucose, là một ví dụ về một loại enzyme, một loại protein xúc tác một phản ứng hóa học bất lợi về mặt năng lượng, theo Viện Tin sinh học Châu Âu.