Một nhóm các cơ quan làm việc cùng nhau để chúng có thể thực hiện một chức năng phức tạp hơn bất kỳ cơ quan đơn lẻ nào được gọi là hệ cơ quan. Mỗi một trong số 11 hệ cơ quan được tìm thấy trong cơ thể con người đều đóng góp vào một số cách để tồn tại tất cả các tế bào sống của nó. Một số cách mà các hệ cơ quan duy trì sự ổn định bên trong cơ thể là thu nhận và phân phối nguyên liệu thô và dinh dưỡng, thu gom và xử lý chất thải, đồng thời bảo vệ cơ thể khỏi bị tấn công và tổn thương.
Các cơ quan riêng lẻ bao gồm các hệ thống cơ quan hoạt động cùng nhau về mặt hóa học và /hoặc vật lý để thực hiện nhiệm vụ chung của chúng. 11 hệ cơ quan của cơ thể người, cũng được tìm thấy ở nhiều loài động vật khác, đó là hệ tiêu hóa, hô hấp, tuần hoàn, hệ xương, cơ, cơ, thần kinh, tiết niệu, sinh sản, nội tiết và hệ bạch huyết. Hệ thống bạch huyết được coi là một phần nhỏ của hệ thống tuần hoàn không vận chuyển máu, mà là hình thành và vận chuyển chất lỏng bạch huyết giúp bảo vệ cơ thể chống lại bệnh tật.
Việc thay thế một số cơ quan không quan trọng trong các hệ cơ quan đã được thực hiện thông qua việc sử dụng chân tay giả hoặc các cơ quan nhân tạo. Tuy nhiên, mức độ thành công thấp hơn đã đạt được trong việc thay thế các cơ quan quan trọng, chẳng hạn như tim hoặc thận, bằng các thiết bị nhân tạo. Cấy ghép nội tạng sống là một cách tiếp cận để thay thế một thành phần quan trọng trong hệ thống cơ quan, nhưng cơ quan được cấy ghép có thể bị hệ thống miễn dịch tự động của người nhận từ chối.