Máy quét ion còn được gọi là thiết bị đo phổ di động ion và được sử dụng vì lý do an ninh để quét các hạt và xác định nguồn gốc của chúng. Nó được sử dụng để phát hiện các chất bất hợp pháp và là một thiết bị hiệu quả công cụ chống buôn bán ma túy và các mối đe dọa khác.
Máy quét ion yêu cầu lập trình để phát hiện các chất hóa học nhất định cũng như bảo trì thường xuyên để giữ được độ chính xác của chúng. Chúng rẻ hơn các lựa chọn thay thế nhằm thực hiện một chức năng tương tự và dễ sử dụng hơn. Các chuyên gia tại Bộ Tư pháp Hoa Kỳ ước tính rằng chỉ mất vài giờ để đào tạo một nhân viên sử dụng máy quét ion.
Các chất nguy hiểm khác như chất nổ, hóa chất nguy hiểm hoặc vũ khí hóa học cũng có thể được phát hiện bằng máy quét ion, mang lại cho thiết bị ứng dụng rộng rãi cho môi trường quân sự và nghiên cứu. Thiết bị đo phổ di động ion rất hữu ích trong việc phát hiện và phân biệt giữa các chất khí khác nhau, tạo cho nó một vị trí trong khoa học phân tích. Các thiết bị IMS cũng được sử dụng trong các cơ sở y tế như một trong những công cụ để phát hiện các vấn đề về phổi ở bệnh nhân, từ đào thải sau khi cấy ghép đến bệnh sarcoidosis và thậm chí là ung thư phổi. Phương pháp phát hiện này được gọi là phân tích khí hơi thở.