Lần phun trào đầu tiên được ghi nhận của Núi Phú Sĩ xảy ra vào năm 781 và nó đã phun trào 16 lần kể từ đó, với lần phun trào cuối cùng được ghi nhận xảy ra vào năm 1707. Núi Phú Sĩ hiện được phân loại là không hoạt động, nhưng phun trào có thể xảy ra một lần nữa vào một thời điểm nào đó trong tương lai. Hiện tại, ngọn núi lửa không có dấu hiệu hoạt động, vì vậy khách du lịch và những người đi bộ đường dài thường đến thăm đỉnh núi.
Núi Phú Sĩ đã phun trào 13 lần trong khoảng thời gian từ năm 781 đến năm 1083. Sau hơn 428 năm không hoạt động, núi lửa lại phun trào vào năm 1511. Nó phun trào hai lần sau đó, với lần phun trào cuối cùng xảy ra vào đầu thế kỷ 18. Vào năm 2001, hoạt động trên cao đã được ghi nhận dưới núi lửa, điều này có thể cho thấy một vụ phun trào sắp xảy ra. Các nhà khoa học không thể dự đoán chính xác khi nào điều này có thể xảy ra, cũng như không thể đảm bảo bất kỳ vụ phun trào nào trong tương lai. Nhật Bản có công nghệ giám sát núi lửa rất tiên tiến và chính phủ giám sát núi lửa chặt chẽ.
Núi Phú Sĩ được cho là đã hình thành từ 700.000 đến 200.000 năm trước. Núi Phú Sĩ là một loại núi lửa được gọi là stratovolcano. Stratovolcanoes là núi lửa lớn nhất trên Trái đất, và chúng hình thành từ sự tích tụ của dung nham nguội và tro. Núi Phú Sĩ cao hơn 12.000 feet so với mực nước biển và là một trong những ngọn núi lửa cao nhất thế giới. Đây là đỉnh núi cao nhất ở Nhật Bản.
