Bánh mì babka có thể có nguồn gốc từ người Do Thái Đông Âu hoặc nó có thể là họ hàng xa của bánh mì pannetone của Ý. Nguồn gốc chính xác của bánh mì babka vẫn chưa được biết rõ.
Bánh mì Babka có thể có nguồn gốc từ Ba Lan hoặc Ukraine. Một giả thuyết cho rằng nó từng là một phần của nghi lễ sinh sản cổ đại như một phần của chế độ mẫu hệ. Loại bánh mì cuộn, nhân này đặc biệt phổ biến ở Nga, Belarus, Baltics, Ba Lan và Ukraine. Tên "babka" có liên quan đến "babcia", từ tiếng Slav để chỉ bà ngoại. Một giả thuyết cho rằng chiếc chảo truyền thống của Ba Lan dùng để nướng babka giống những nếp gấp trên váy của một bà già. Một giả thuyết khác về cái tên này cho rằng bà nội là những người làm bánh chính cho món ăn này.
Một giả thuyết khác cho rằng babka thực sự có nguồn gốc từ Ý, nơi nó được coi là phiên bản "Russified" của bánh mì pannetone của Ý. Có thể Nữ hoàng Bona Sforza đã mang theo truyền thống của mình đến Ba Lan vào thế kỷ 16. Ý tưởng cho rằng babka có nguồn gốc từ Ý được ủng hộ bởi việc đưa sô cô la vào một số phiên bản. Người Do Thái trở thành những người bán sôcôla ở Ý, và họ mang theo truyền thống này khi chạy trốn khỏi Tòa án Dị giáo Tây Ban Nha vào thế kỷ 15.
Babka đã từng lớn hơn nhiều so với phiên bản hiện tại. Vào đầu thế kỷ 19, các thợ làm bánh Ba Lan bắt đầu sử dụng bột challah trứng để làm món tráng miệng phết mứt, quế hoặc nho khô, là nguyên liệu cơ bản của bánh mì babka hiện đại.