Để nấu trân châu bột sắn, hãy bắt đầu với lượng nước ít nhất gấp bốn lần trân châu bột sắn. Đun sôi trân châu trong nước trong 30 phút, thỉnh thoảng khuấy đều. Tắt bếp và ngâm trân châu trong 30 phút, đậy nắp lại. Xả ngọc trai và rửa sạch bằng nước lạnh.
Ngọc trai khoai mì nên được phủ một lớp xi-rô đường trước khi ăn. Càng nấu nhiều trân châu thì tỷ lệ nước và trân châu càng cao. Ví dụ, ba kg trân châu nên được nấu với lượng nước gấp sáu lần. Trân châu bột sắn là thành phần chính trong món chè trân châu.
