Cladistics minh họa các mối quan hệ tiến hóa ngày càng phát triển giữa các dạng sống, trong khi hệ thống Linnaean phân loại các sinh vật theo các đặc điểm vật lý cố định. Cladistics tổ chức tất cả sự sống trong khuôn khổ của thuyết tiến hóa, trong khi hệ thống Linnaean đạt đến quay lại khái niệm tên khoa học của Aristotle.
Cladistics là một phương pháp được phát triển để ghép nối mô hình tiến hóa với nhu cầu thực tế về phân loại sinh vật. Cladistics hiển thị các nhánh của quá trình tiến hóa và cho phép người dùng xem một loài có liên quan chặt chẽ như thế nào với loài khác tại bất kỳ thời điểm nào trong lịch sử tiến hóa của chúng. Cladistics tổ chức sự sống phù hợp với lịch sử phát triển hơn là sự giống nhau của dạng sống này với dạng sống khác tại bất kỳ thời điểm nào. Cladistics không nhằm mục đích sử dụng cho công việc bên ngoài liên quan đến thuyết tiến hóa.
Carl Linnaeus đã phát triển hệ thống của mình trong nỗ lực cung cấp cho mọi dạng sống riêng biệt một cái tên phổ quát và một vị trí trong cấu trúc của tất cả sự sống theo những điểm tương đồng về thể chất. Cấu trúc này chỉ định một loài, chi, họ, thứ tự, lớp và vương quốc cho mỗi sinh vật. Linnaeus dựa trên một mô hình phân loại trước đây do Aristotle đưa ra, mặc dù Linnaeus đã thay đổi và mở rộng mô hình của Aristotle. Hệ thống Linnaean nhóm các loài có những điểm tương đồng về thể chất lại với nhau bất kể những cách thức khác nhau mà những đặc điểm đó được phát triển ở mỗi loài.
