Hydro peroxit giết vi khuẩn bằng cách oxy hóa thành tế bào của chúng, lấy cắp các điện tử từ chúng và phá vỡ cấu trúc hóa học của chúng. Hydro peroxit là một hợp chất có hai nguyên tử hydro và hai nguyên tử oxy. Nó rất giống với nước, nhưng nó có thêm một nguyên tử oxy được loại bỏ để sẵn sàng phản ứng với môi trường của nó, thường theo những cách phá hoại các sinh vật xung quanh.
Ôxy phá hủy trong hydrogen peroxide được gọi là một gốc tự do. Nhóm peroxide, bao gồm hai ion oxy, phản ứng với thành tế bào vi khuẩn và các cấu trúc của tế bào khác. Mỗi nguyên tử oxy có một điện tử chưa ghép đôi, điện tử này rất không ổn định và khiến nó phản ứng cực mạnh.
Trong khi hydrogen peroxide là một chất khử trùng phổ biến do đặc tính tiêu diệt vi khuẩn của nó, nhưng nó lại nguy hiểm cho các tế bào của con người cũng như vi khuẩn. Nó làm tổn thương các mô xung quanh nếu để vết thương quá lâu. Ở nồng độ cao hơn, nó có tính ăn mòn. Tuy nhiên, cơ thể có một số biện pháp bảo vệ chống lại hoạt động này, hoạt động này tạo ra bọt thường được ghi nhận sau khi sử dụng hydrogen peroxide.
Cơ thể con người có một số enzym nhất định giúp phá vỡ các peroxit trước khi chúng gây ra quá nhiều thiệt hại, bởi vì các gốc tự do như vậy được hình thành tự nhiên trong quá trình hô hấp hiếu khí. Sự tập trung vào các chất chống oxy hóa trong chế độ ăn uống trong những năm gần đây bắt nguồn từ các gốc tự do chuyển hóa gây hại cho các tế bào của con người giống như cách mà peroxide được sản xuất đã làm.