Hydro không có neutron, chỉ có một proton và một electron. Phần lớn khối lượng của một nguyên tử nằm trong các proton và neutron của nó; hiđrô có khối lượng bằng 1 vì khối lượng của một proton đơn lẻ của nó.
Hydro có ba đồng vị phổ biến: proti, đơteri và triti. Các đồng vị có cùng số hiệu nguyên tử, nghĩa là chúng là cùng một nguyên tố vì chúng có cùng số proton và electron; tuy nhiên, khối lượng của chúng khác nhau vì chúng có số lượng neutron khác nhau. Proti không có nơtron, đơteri có một nơtron và triti có hai nơtron. Đồng vị phổ biến nhất là proti, chiếm 99,9% hydro trong tự nhiên. Nước nặng, đặc hơn và nặng hơn nước bình thường, bao gồm hydro ở dạng đơteri. Triti là chất phóng xạ và được hình thành trong khí quyển.
