Theo Đại học Washington, hệ thống thần kinh hoạt động với các hệ thống cơ thể khác bằng cách gửi lệnh đến các hệ thống khác và nhận lại thông tin từ chúng. Ngoài ra, một số hệ thống và cấu trúc của cơ thể, chẳng hạn như như đốt sống và hộp sọ, giúp bảo vệ hệ thần kinh trung ương.
Theo LiveScience, hệ thần kinh là tập hợp các dây thần kinh, tế bào thần kinh và các cơ quan khác, bao gồm cả não. Các thành phần này gửi và nhận tin nhắn đến và đi từ các bộ phận khác nhau của cơ thể. Con người và các động vật có xương sống khác có cả hệ thần kinh trung ương và hệ thần kinh ngoại vi.
Hệ thống cơ là một ví dụ điển hình về hệ thống cơ quan hoạt động với hệ thần kinh. Theo Đại học Washington, các thụ thể trong cơ gửi thông tin đến não liên quan đến vị trí và chuyển động của một cơ hoặc một nhóm cơ. Tuy nhiên, luồng thông tin thay đổi khi não tìm cách điều khiển chuyển động của cơ xương bằng cách gửi tín hiệu đến các cơ.
Đại học Washington cũng giải thích sự hợp tác giữa hệ thần kinh với hệ thống bạch huyết và hô hấp. Bộ não phát tín hiệu cho hệ thống bạch huyết để bảo vệ chống lại các mầm bệnh, về cơ bản điều phối phản ứng miễn dịch. Hệ thống hô hấp được điều khiển bởi hệ thống thần kinh trung ương. Bộ não theo dõi lượng khí trong máu và điều chỉnh nhịp hô hấp.