Hô hấp tế bào và lên men là hai con đường sau quá trình đường phân. Hô hấp tế bào cần oxy, trong khi quá trình lên men xảy ra khi không có oxy. Hô hấp tế bào bao gồm một con đường hóa học được đặt tên là chu trình Krebs hoặc chu trình axit xitric, tiếp theo là một hệ thống vận chuyển điện tử.
Một phản ứng chuyển tiếp xảy ra sau quá trình đường phân và trước khi bắt đầu quá trình hô hấp hoặc lên men. Pyruvate, sản phẩm của quá trình đường phân, được xử lý thành acetyl-CoA, một phân tử năng lượng cao. Các phản ứng chu trình Krebs xử lý acetyl-CoA thành các phân tử mang điện tử ATP và NADH. Hệ thống vận chuyển điện tử đi qua các màng gradient hóa học để tạo ra ATP bổ sung được sử dụng để cung cấp năng lượng cho các quá trình tế bào. Quá trình lên men chuyển acetyl-CoA thành etanol hoặc axit lactic.
