Thức ăn không được tiêu hóa đúng cách trong dạ dày cuối cùng sẽ được đẩy qua phần còn lại của đường tiêu hóa và thoát ra khỏi cơ thể qua trực tràng dưới dạng phân. Cơ thể xử lý thức ăn không tiêu hóa giống như bất kỳ chất nào khác mà dạ dày không thể phân hủy.
Cơ thể không có khả năng chiết xuất đầy đủ các chất dinh dưỡng từ thức ăn được gọi là chứng kém hấp thu. Điều này có thể xảy ra do thiếu hụt hoặc gián đoạn các enzym tiêu hóa. Các triệu chứng của chứng kém hấp thu bao gồm tiêu chảy, sụt cân và phân lớn và có mùi khó chịu. Các bác sĩ kiểm tra khả năng kém hấp thu bằng cách kiểm tra chất béo trong phân. Trong một số trường hợp, sinh thiết ruột non là cần thiết.
