Phần lớn hoạt động của chuỗi vận chuyển điện tử xảy ra ở màng trong ti thể của tế bào. Đây là nơi chuỗi vận chuyển điện tử nhận được các protein cần thiết để hoạt động bình thường.
Chuỗi vận chuyển điện tử là bước cuối cùng của quá trình hô hấp tế bào. Trong bước này, các điện tử bị tách khỏi FADH2 và NADH. Sau đó, chúng được chuyển đến các phân tử oxy để tạo ra nước. Chuỗi vận chuyển điện tử dựa vào ba phức hợp protein màng tích hợp để hoạt động bình thường: phức hợp NADH dehydrogenase, phức hợp cytochrome c reductase và phức hợp cytochrome c oxidase. Phần lớn ATP được tạo ra trong quá trình hô hấp tế bào được tạo ra bởi chuỗi vận chuyển điện tử.