Archaea, vi khuẩn, Protista, nấm, vi rút và vi sinh vật hợp nhất là các bộ phận có chứa vi sinh vật. Hầu hết vi sinh vật là sinh vật đơn bào. Men làm bánh và men phân hạch là những vi sinh vật đơn bào.
Archaea là những sinh vật đơn bào không có nhân. Archaea được tìm thấy ở tất cả các loại môi trường sống.
Vi khuẩn là những sinh vật đơn bào phức tạp, có thể tồn tại trong môi trường khắc nghiệt. Vi khuẩn có nhiệm vụ tạo ra vitamin, phân hủy vật chất và duy trì bầu không khí. Vi khuẩn đã xuất hiện trên Trái đất hàng tỷ năm trước.Microbe World giải thích rằng nhiều loài nấm được phân loại là vi sinh vật. Nấm là vi sinh vật có chung một thành tế bào với nhiều nhân nằm rải rác khắp cơ thể sinh vật.
Protista là những vi sinh vật nhân thực có DNA của chúng được bao bọc trong nhân. Tảo đơn bào, động vật nguyên sinh, nấm nhầy và nấm mốc nước là bốn phân nhóm của Nguyên sinh vật.
Vi rút là những vi sinh vật không phù hợp với nhóm sống hoặc không sống. Ở trạng thái trơ, vi rút hoạt động như những sinh vật không sống, nhưng một khi tiếp xúc với vật chủ thích hợp, chúng sẽ thể hiện những phẩm chất giống như thật. Vi rút là những vi sinh vật đơn giản nhỏ hơn vi khuẩn 10.000 lần. Vi rút chứa một lượng nhỏ vật chất di truyền.
Vi sinh vật sát nhập là các vi sinh vật bao gồm Rhizobia, Mycorrhizae và Zooxanthelle. Mỗi vi sinh vật này có mối quan hệ tương hỗ với một sinh vật khác.
