Có nhiều báo cáo trái chiều về sự an toàn của cá thiên nga. Trong khi những người nuôi cá da trơn ở Mỹ cho rằng cá da trơn là không an toàn, những người khác lại cho rằng điều này gây ra nhiều lo sợ hơn nhằm mục đích ngăn chặn một loại cá nhập khẩu rẻ hơn từ Mỹ thị trường.
Mặc dù phải tuân theo các quy định an toàn thực phẩm giống như bất kỳ loài cá nào khác, nhưng các loài động vật này đến từ một khu vực nổi tiếng về ô nhiễm nguồn nước. Đồng bằng sông Cửu Long ở Việt Nam, nơi có một số loài thiên nga được nuôi trực tiếp, được coi là bị ô nhiễm nặng bởi một số nguồn nhất định. Giống như các loài cá da trơn khác được đánh bắt hoặc nuôi cho mục đích ẩm thực, thiên nga rất chịu được ô nhiễm và có thể sống trong môi trường nước có thể giết chết các loài khác.
Các nghiên cứu đã phát hiện ra rằng cá thiên nga có giá tốt hơn về chất lượng, an toàn và sức khỏe so với các loại cá da trơn khác. Thịt cá chứa hàm lượng thủy ngân đặc biệt thấp so với các loại hải sản khác.