Theo BBC, có nhiều lợi thế khi có bộ xương trong hơn là bộ xương ngoài, bao gồm một bộ khung vững chắc cho cơ thể và khả năng phát triển liên tục. Bộ xương ngoài không phát triển cùng với cơ thể, hạn chế đáng kể tầm vóc của bất kỳ sinh vật nào.
Bộ xương bên trong cung cấp cấu trúc cơ thể, cho phép các cơ quan nằm trong các khu vực riêng biệt của thân trong khi vẫn cung cấp cấu trúc thẳng đứng. Xương sườn và hộp sọ bảo vệ tim, phổi và não trong khi các đốt sống tạo cho cơ thể con người cấu trúc thẳng đứng. Bởi vì khung xương cũng phát triển khi cơ thể con người lớn lên, các cơ quan và hệ cơ được phép phát triển đầy đủ cho đến khi cơ thể đạt đến độ trưởng thành về thể chất. Hệ thống Đại học Bang New York lưu ý rằng các bộ xương nội soi thích nghi hơn với việc hỗ trợ trọng lượng lớn hơn vì chúng có thể làm như vậy mà không trở nên quá nặng. Bộ xương cũng phát triển thuận lợi mà không cần trải qua quá trình lột xác của bộ xương ngoài.
Bộ xương cho phép gắn các cơ dễ dàng và linh hoạt. Chúng có rất nhiều khớp, giúp cơ thể có phạm vi chuyển động lớn hơn nhiều so với xương ngoài. Tương tự như vậy, các cơ gắn trực tiếp vào khung xương, cho phép các chuyển động chính xác hơn và các kỹ năng vận động tốt hơn.