Thỏa thuận Missouri rất quan trọng vì nó đã củng cố Liên minh trong hơn 30 năm, mặc dù có những lo ngại về việc thành lập các quốc gia mới với tư cách là các quốc gia nô lệ. Trong các sự kiện dẫn đến thỏa hiệp, miền Bắc đã lo ngại về việc thành lập các bang mới với tư cách là các bang nô lệ, trong khi miền Nam lo ngại về việc để Quốc hội xâm phạm quyền của mỗi bang trong việc đưa ra luật về chế độ nô lệ của riêng mình.
Trước Thỏa thuận Missouri năm 1820, Missouri muốn gia nhập Liên minh với tư cách là một quốc gia nô lệ, nhưng Quốc hội lo ngại về sự mở rộng chế độ nô lệ trên khắp Hoa Kỳ Khi Missouri đưa ra yêu cầu gia nhập với tư cách là một quốc gia nô lệ, có 22 quốc gia thành viên . Vì có sự phân chia bình đẳng giữa các quốc gia nô lệ và tự do, Quốc hội lo ngại rằng việc thêm một quốc gia nô lệ khác sẽ làm đảo lộn sự cân bằng. Như một sự thỏa hiệp, nó đồng ý thừa nhận Missouri, nhưng cũng thiết lập Maine là một quốc gia tự do và vẽ một đường biên giới tưởng tượng qua Louisiana sẽ chia nó thành các khu vực nô lệ và tự do.
Mặc dù Thỏa hiệp tạm thời tạo ra sự bình tĩnh về vấn đề này, cả miền Bắc và miền Nam đều có những lo ngại. Trong khi miền Bắc tin rằng điều này khuyến khích việc mở rộng chế độ nô lệ trong toàn liên minh, miền Nam coi quyết định này là cho phép Quốc hội phá vỡ chủ quyền của nhà nước. Thỏa hiệp sau đó đã bị thu hồi vào năm 1854 với Đạo luật Kansas-Nebraska.