Một trong những mối đe dọa lớn nhất đối với lãnh nguyên là sự nóng lên toàn cầu. Khi nhiên liệu hóa thạch cháy ở những nơi khác trên hành tinh, bầu khí quyển ấm lên ở tất cả các địa điểm. Điều này gây ra sự tan chảy của lớp băng vĩnh cửu, dẫn đến sự sụp đổ của các hệ sinh thái lãnh nguyên. Theo Marietta College, khi lớp băng vĩnh cửu tan chảy, nó cho phép vật liệu thực vật đông lạnh phân hủy, giải phóng nhiều carbon dioxide hơn và làm tăng tốc độ ấm lên toàn cầu.
Sự phát triển dầu khí cũng ảnh hưởng đến lãnh nguyên. Trong khi dầu khó khai thác từ lãnh nguyên, các lợi ích doanh nghiệp thúc đẩy ý tưởng rằng việc khoan ở các vùng Bắc Cực có khả năng bù đắp giá dầu cao. Ngoài ra, sự cố tràn dầu, chẳng hạn như sự cố từ vụ tai nạn tàu chở dầu Exxon Valdez ngày 24 tháng 3 năm 1989, ảnh hưởng đến động vật hoang dã trong lãnh nguyên. Vụ va chạm duy nhất này là nguyên nhân dẫn đến cái chết của 100.000 con chim bị mắc kẹt trong dầu. Ngoài ra, cá, bao gồm cá bơn, cá trích và cá hồi, chết do thảm họa. Trong khi phần lớn lượng dầu từ vụ tràn đã được loại bỏ, một số vẫn tiếp tục ảnh hưởng đến lãnh nguyên, theo Internetgeography.
Trong khi thời tiết khắc nghiệt ngăn cản hầu hết mọi người sống trên lãnh nguyên, các vấn đề ô nhiễm từ việc định cư của con người lại rất nghiêm trọng ở khu vực địa phương của họ. Các phương pháp xử lý nước thải truyền thống không hoạt động trong môi trường lạnh.
Các chất ô nhiễm trong không khí do con người tạo ra đã đến các vùng xa xôi của lãnh nguyên. Các nhà khoa học đã tìm thấy các chất ô nhiễm do con người tạo ra, bao gồm DDT và PCB, với số lượng có thể đo được trên toàn khu vực, cách xa khu vực sản xuất chúng.