Nấm là sinh vật đa bào, nhân thực, trong khi vi khuẩn là sinh vật nhân sơ đơn bào. Tế bào của nấm có nhân chứa nhiễm sắc thể và các bào quan khác, chẳng hạn như ti thể và ribosom. Vi khuẩn nhỏ hơn nhiều so với nấm, không có nhân hoặc các bào quan khác và không thể sinh sản hữu tính.
Tất cả các sinh vật nhân thực, bao gồm cả thực vật, động vật và nấm, đều có tế bào với nhân và một lượng lớn các bào quan phức tạp được sử dụng để thực hiện các chức năng sinh học khác nhau. Nấm có thành tế bào và sinh sản cả hữu tính và vô tính thông qua việc sử dụng bào tử. Chúng không có khả năng quang hợp và phải hấp thụ chất dinh dưỡng bằng cách phân hủy chất hữu cơ. Nhiều loài nấm đóng vai trò quan trọng trong hệ sinh thái bằng cách phân hủy thực vật và động vật chết. Các nhà khoa học ước tính rằng có hơn 2 triệu loài nấm trên Trái đất.
Vi khuẩn là một trong hai loại sinh vật nhân sơ chính cùng với vi khuẩn cổ. Không giống như nấm, tế bào của chúng không chứa nhân. Thay vào đó, DNA của chúng được tìm thấy trên một nhiễm sắc thể hình tròn trôi nổi trong tế bào chất. Vi khuẩn thường sinh sản thông qua phân hạch, tạo ra hai tế bào con giống hệt nhau. Mặc dù vi khuẩn có thể liên kết với nhau thành các cấu trúc phức tạp được gọi là màng sinh học, nhưng chúng không phải là các sinh vật đa bào thực thụ. Thay vào đó, mỗi vi khuẩn riêng lẻ vẫn là một sinh vật riêng biệt.
