Một proton nặng hơn electron khoảng 2.000 lần. Proton và electron, cùng với neutron, là các hạt phụ nguyên tử chính tạo nên một nguyên tử.
Các proton và electron có điện tích bằng nhau nhưng trái dấu. Trong hầu hết các trường hợp, nguyên tử có số proton và electron bằng nhau. Tuy nhiên, vì proton nặng hơn electron rất nhiều, nên các electron không đóng góp đáng kể vào khối lượng của nguyên tử. Khối lượng của nguyên tử được biểu thị bằng đơn vị khối lượng tương đối gọi là đơn vị khối lượng nguyên tử hoặc a.m.u. Proton có khối lượng 1,007277 a.m.u. và electron có khối lượng 0,00054858 a.m.u.