Protein được tạo thành từ các axit amin. Tất cả các protein được tạo ra trong cơ thể sống đều bao gồm sự kết hợp của 20 axit amin. Chúng chứa cacbon, hydro, oxy, nitơ và đôi khi là lưu huỳnh và phốt pho.
Trình tự duy nhất của các axit amin tạo nên protein được gọi là cấu trúc cơ bản của protein. Các axit amin kết nối với nhau thông qua các liên kết hóa học ở cấp độ phân tử. Mỗi axit amin có một công thức chung gắn với một chuỗi bên. Các axit amin khác nhau dựa trên loại chuỗi bên mà chúng sở hữu. Sự tương tác giữa các chuỗi bên trên các axit amin khác nhau gây ra sự tạo vòng và gấp, quyết định hình dạng của protein.