Canxi cacbonat phản ứng với axit clohiđric để tạo thành canxi clorua, nước và khí cacbonic. Phản ứng giữa hai hợp chất này yêu cầu hai phần axit clohydric với một phần canxi clorua. Phản ứng này diễn ra khá nhanh và tràn đầy năng lượng ở nồng độ cao, một phần lớn là do ái lực cao của ion canxi đối với ion clorua.
Cả hai hợp chất này đều là ion, với ion hydro liên kết với ion clorua trong axit clohydric và ion canxi liên kết với nhóm cacbonat trong canxi cacbonat. Nhóm cacbonat thực sự là cacbon và oxy liên kết cộng hóa trị, nhưng toàn bộ canxi cacbonat là ion. Hai ion clorua liên kết với một ion canxi. Ái lực cao của ion hydro với oxy sẽ tách nhóm cacbonat ra, liên kết cộng hóa trị với một ion oxy để tạo thành phân tử nước. Nhóm cacbonat, bị loại bỏ một ion oxy, trở thành một phân tử carbon dioxide trung tính.
Axit trong dạ dày là axit clohydric, vì vậy canxi cacbonat thường được sử dụng làm thuốc kháng axit vì các sản phẩm của phản ứng này vô hại đối với con người. Cơ thể sử dụng một hợp chất hơi tương tự, bicarbonate, để tự trung hòa axit trong dạ dày. Axit clohydric cũng là một thành phần của mưa axit. Điều này có thể gây ra xói mòn nặng ở đá vôi, thành phần chủ yếu là canxi cacbonat.
