Phấn hoa được hình thành trong bao phấn của cây mang hạt. Bao phấn là phần đực của cây. Phấn hoa được vận chuyển đến nhụy hoa, đó là phần cái của cây.
Các hạt phấn hoa khác nhau về hình dạng và cấu trúc, và là một phần của khối lượng vi cầu tạo nên phấn hoa. Phấn hoa xuất hiện dưới dạng bụi mịn. Hạt phấn chứa ba phần rõ rệt: phần trung tâm tế bào chất, phần trong và phần ngoài. Trung tâm tế bào chất làm nhiệm vụ thụ tinh. Intine và exine tạo nên thành của hạt phấn hoa, với intine là lớp bên trong và exine là lớp bên ngoài.
