Vi khuẩn hiếu khí sử dụng quá trình hô hấp hiếu khí. Các sinh vật được phân loại là vi khuẩn hiếu khí là sinh vật nhân chuẩn và sống trong môi trường có oxy. Hầu hết các loài thực vật và động vật được phân loại là sinh vật hiếu khí. Hô hấp là quá trình phân hủy glucose để tạo năng lượng cho tế bào. Hô hấp hiếu khí cần oxy để phân hủy glucose.
Các sinh vật được phân loại theo cách chúng tạo ra năng lượng thông qua hô hấp. Các sinh vật cần oxy được gọi là sinh vật hiếu khí bắt buộc. Một số sinh vật có thể phân hủy glucose mà không cần sử dụng oxy thông qua một quá trình gọi là hô hấp kỵ khí. Những sinh vật này được gọi là vi khuẩn kỵ khí dễ nuôi. Hầu hết các vi khuẩn kỵ khí là sinh vật nhân sơ như vi khuẩn.
Hai cách phân loại khác liên quan đến sự hiện diện của oxy. Các sinh vật không dung nạp thích phân hủy đường một cách kỵ khí nhưng có thể tồn tại trong điều kiện có oxy. Microaerophiles sử dụng một lượng rất nhỏ oxy trong quá trình hô hấp.
Các tế bào riêng lẻ của con người có thể tạo ra năng lượng có hoặc không sử dụng oxy. Hô hấp kỵ khí được thực hiện bởi các tế bào cơ khi oxy không được hít vào đủ nhanh để cung cấp năng lượng cần thiết trong thời gian vận động. Hô hấp kỵ khí không tạo ra nhiều năng lượng nên không thể duy trì trong thời gian dài. Axit lactic là sản phẩm của quá trình hô hấp kỵ khí. Tế bào không thể sử dụng axit lactic và nó phải được đào thải ra ngoài.